Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
50 Cards in this Set
- Front
- Back
|
Vilket genetiskt material finns det? |
DNA sträng = nukleotider, information om vilka ämnen som skall bildas, hur de ska se ut Kromosomer Gener = recept på proteiner och ämnen som behövs i kroppen |
|
|
Vad kan orsaka genetiska medfödda sjukdomar? |
Kromosomrubbningar Sjukdomar orsakade av förändringar på gennivå (monogena) Sjukdomar med genetiskt bidrag (multifaktoriella sjukdomar) |
|
|
Hur indelas sjukdomar orsakade av förändringar på gennivå (monogena)? |
De indelas efter nedärvningsmönster: Autosomalt dominant Autosomalt recessiv X-bunden (Mitokondriell nedärvning) |
|
|
Vad är specifikt för autosomalt dominant nedärvda sjukdomar? |
En av föräldrarna är sjuk och är mutationsbärare = 50 % av barnen kan få samma sjukdom Ett sjukt anlag räcker för att bli sjuk Genomslagskraften (penetrans) och sjukdomsgraden (expressivitet) varierar och är åldersberoende |
|
|
Vad är specifikt för autosomalt recessivt nedärvda sjukdomar? |
Bägge föräldrarna är friska men bärare av mutationen = 25% risk att få ett sjukt barn Måste ärva 2 kopior av den förändrade genen för att få det genetiska syndromet Alla bär på 5-8 anlag för recessiva sjukdomar Ökad risk vid släktskap mellan föräldrarna Ofta allvarligare än dominanta sjukdomar, ex cystisk fibros |
|
|
Vad händer om en pappa bär på ett X-bundet dominant anlag? |
Alla döttrar blir sjuka, eftersom de får det X:et från sin pappa. Därav räcker det med ett sjukt anlag |
|
|
Vad händer om en mamma bär på ett X-bundet recessivt anlag? |
Döttrarna är friska, men bär på anlaget för mutationen. Sönerna blir sjuka, eftersom de får ett X från mamman och ett Y från pappan som är frisk |
|
|
Vilka mutationer kan uppstå vad gäller kromosomer? (Rubbningar) |
Numeriska: aneuploidi (3 stycken kromosom 21. Det vill säga ex 47,XX) Strukturella: translokation, deletion, insertion, duplikation, isokromosom |
|
|
Vilka genmutationer kan ske? |
Punktmutation = basparsutbyte. Silent mutation (aminosyra oförändrad), missense mutation (aminosyranyte, nonsense mutation (stopp-kodon) Baspar deletion, insertion, duplikation (frame-shift, stopp-kodon doseffekt) |
|
|
Med vilka analyser kan man får översikt över hela genomet? |
Kromosomanalys (G-bandning) SNP (single nucleotide polymorphism) - array |
|
|
Med vilka metoder kan man analysera specifika kromosomområden? |
FISH - genspecifika prober (CATCH22, Williams syndrom) Subtelomera prober |
|
|
Med vilka metoder kan man analysera gener? |
PCR-baserade metoder: Fragmentanalys (Huntington, DM1) QF-PCR (fosterdiagnostik) MLPA (CMT, HNPP) Sekvensering (Cystisk fibros) |
|
|
När utförs en cytogenetisk kromosomanalys? |
Vid misstanke om att en patient har en hel kromosom extra (trisomi) eller när det fattas en stor del av kromosom (pga deletion eller translokation) |
|
|
Hur går FISH till? |
Analys av specifika kromosomområden Upplösning ca 50 000 baspar Analys av cellernas DNA på objektsglas efter hybridisering med fluorescentmärkt sond (prob) identisk med sekvens av undersökta genen |
|
|
Vilka är fördelarna med FISH? |
Resultat inom 12-24 timmar Hög sensitivitet Många interfaskärnor kan analyseras Dålig kromosomsrruktur ej ett problem (kollar inte på banden, utan gener) |
|
|
Vad färgar FISH prober in? |
Centromer område Hela kromosomen Lokus eller gen Subtelomer och telomer område |
|
|
Var kan en mutation ske? |
I exon eller i intron Ex i intronens spliceosom, gör att exon och intron ej kan skiljas på Aminosyrabyte kan även leda till att spliceosomen klipps fel |
|
|
Vad kan en mutation leda till? |
Sjukdom En normal variant Riskallel |
|
|
Vad görs om det handlar om en känd mutation? |
En riktad analys mot en känd genetisk förändring utförs Bekräftar diagnos molekylärt Identifierar anlagsbärare |
|
|
Vad är viktigt att göra vid PCR? |
Välja ut lämpliga exon Designa primers Optimera PCR |
|
|
Vad är Bothniadystrofi? |
En näthinnesjukdom som leder till blindhet Autosomalt recessiv nedärvning Utbyte av arginin till tryptofan |
|
|
Vad görs om en mutation är okänd? |
En screening utförs - förutsättningslöst sökande efter en okänd genetisk förändring Mutationsscreening |
|
|
Vad är epidermolysis bullosa (EB)? |
Ärftlig benägenhet för blåsbildningar i huden finns i 3 former: simplex, dystrofisk, junktional Drabbar slemhinnor, känslig för beröring (leder till hudavlossning), vätskeförlust och extremt infektionskänslig Recessiv nedärvning |
|
|
Vad innebär en penetrans på 100%? |
Att sannolikheten för att en person med en viss genvarianter ska få det fenotypiska uttrycker är 100%. Alltså hur stort genomslag den undersökta genens egenskap får hos bärarna i en population |
|
|
Vad görs i en sekvensering? |
Bestämmer basernas ordning i DNA sekvens Denna sekvens jämförs med referens/databas sekvens Sekvensförändringar analyseras och bedöms som polymorfi eller mutation |
|
|
Hur fungerar en sanger sekvensering? |
PCR produkt Primer tillsätts till en sträng ddNTPs är inmärkta med fluoroforer Inkorporeringen av en ddNTP sätter stopp för syntesen Resultatet blir ett antal DNA fragment som skiljer sig i längd med sista fluorescensinmärkta nukleotiden |
|
|
Hur utvärderas DNA-avvikelser? |
Kunskap om patogenesen bakom sjukdomen Kunskap om den gen eller det protein som undersökts Typ av mutation: stopp eller missense Studera databaser och litteraturen: har den beskrivits förut? Bioinformatiska verktyg: konserverad region, aminosyrautbyte, trunkerad protein Frekvens |
|
|
Vad är en genetisk heterogenitet? |
Flera olika gener ger liknande symptombild (fenotyp) Mutationer förekommer i många olika positioner i samma gen Olika typer av mutationer förekommer i en och samma gen |
|
|
Vad kan orsaka neurodegenerativa sjukdomar? |
Trinukleotid-repetitioner |
|
|
Vilka är de icke-kodande delarna som kan ge mutation? |
Promotor - genuttryck UTR - mRNA-stabilitet, proteinuttryck Intron - mRNA-stabilitet, splicing |
|
|
Vilken är den kodande delen som kan ge mutation? |
Exon - förändrar proteinsekvensen |
|
|
Beskriv Huntingtons sjukdom |
Autosomal dominant Mutation (CAG-repetition) i HD-genen som kodar för transkriptionsreglerande protein (huntingtin) Degenerativ sjukdom, påverkar bla rörelseförmågan Premutation Anticipation (paternell) - antalet repetitioner = svårighetsgrad och debutålder Incidens 1/8000 |
|
|
Symtom vid Huntingtons sjukdom |
Depression Personlighets-förändring Chorea Hyperreflexi Demens Avvikande ögonrörelser |
|
|
Beskriv dystrofia myotonica |
Autosomal dominant Mutation (CTG-repetition) i DMPK-genen som kodar för proteinkinas Anticipation (maternell) Incidens 1/8000 |
|
|
Symtom vid dystrofia myotonica |
Andningsinsufficiens Hypotoni Matningssvårigheter Svår mental retardation Frånvaro av myotoni i spädbarnsåldern |
|
|
Vad ses på en fragmentanalys? |
Det ska synas 2 stycken toppar, kollar på hur stora de är (PCR-produkten), alltså hur många repetitioner som finns ex 21/40 då kanske gränsen är 36 |
|
|
Hur utförs en southern blot? |
Extrahera DNA från blodprov Klipp DNA med restriktions-enzym Separera på agarosgel Denaturera fragment i gel Överför till membran (blot) Tillsätt inmärkt prob Hybridisera med prob till DNA på membranet Tvätta bort ospecifikt inbunden prob Exponera film |
|
|
Repeat primer PCR |
Får fram olika stora fragment pga flera annaealing sites på templatet. Screenar efter exempelvis fragil X |
|
|
Vilka olika markörer finns det? |
STR - short tandem repeat eller SNPar Polymorfa Repeats inmärkta med fluoroforer (färger) Ligger i icke sjukdomsregioner |
|
|
Vilken analys kan användas för fosterdiagnostik? |
QF-PCR (kvantitativ fluorescent PCR) Markörer på kromosom 13 (Pataus syndrom), 18 (Edwards syndrom) 21, XY Fostervattensprov eller moderkakabiopsi |
|
|
Vad är viktigt vid QF-PCR? |
Att stoppa den innan platån i slutet av kurvan, annars blir topparna lika stora |
|
|
Charcot-Marie-Tooth sjukdom |
Genetiskt heterogen grupp sjukdomar med olika nedärvningsmönster Minst 40 olika gener kända 50% CMT typ 1 (autosomalt dominant) Av patienter med CMT1A har de flesta en deletion av PMP22-genen |
|
|
Hur testar man för deletioner av hela genen? |
PCR Maternell: har från 1-8 Paternell: har 1-3 och 5-8 men inte 4 allellen Man ser deletioner genom att det blir totalt två stycken 4:or iställlet för 8 stycken om pappan hade haft allel 4 |
|
|
Vad är MLPA? |
Multiplex ligation dependent probe amplification Detekterar stora deletioner eller duplikationer som missas med PCR-teknik Av hela exon, en hel gen eller flera gener Screening av hela gener eller flera gener i en enda reaktion Labtekniskt enkel metod med kommersiella kit Relativt omfattande beräkningar för tolkning av data |
|
|
SNP-array |
Översikt över hela genomet Hybridisering av patientens DNA mot genetiska markörer, SNPs Väldigt känslig i jämförelse med vanlig kromosomanalys Upplösningen beror på hur många SNPs arrayen innehåller samt hur stor del av genomet dessa representerar Copy number variations, CNV's |
|
|
Fördelar med SNP-array |
100-1000 FISH/test Materialmängd Duplikationer Deletioner Postmortem material Mindre arbetsinsats Billigare Upptäcker mosaicism |
|
|
Nackdelar med SNP-array |
Inte punktmutationer Inte balanserade translokationer Inte inversioners brottspunkter Inte mindre deletioner/duplikationer |
|
|
Hur uppstår multifaktoriella/komplexa sjukdomar? |
Många gener samverkar Olika gener kan bidra till sjukdoms-utvecklingen i olika individer Mutationen oftast ej allvarlig, vanligen naturliga variationer (riskfaktorer) Miljöfaktorer |
|
|
Hur kan samma sjukdom vara familjär? |
I familjära former av sjukdomen = en gen har ofta en allvarligare mutation Denna mutation är tillräckligt allvarlig för att ensam leda till sjukdom |
|
|
Viktigt vid komplexa sjukdomar |
Prevention! Ex risk för stroke, rök inte! Tänk på vad du äter |
